El ICTA tiene como propósito la generación, divulgación y transferencia de nuevos conocimientos científicos y tecnológicos en la ciencia y la tecnología de los alimentos. Las investigaciones abarcan diversos asuntos de la postcosecha de alimentos, la transformación de los alimentos y el comportamiento del consumidor en el contexto de alimentación, dando mayor énfasis al estudio de alimentos de interés comercial en la región Cajamarca y el país, así como el planteamiento de soluciones a la problemática de alimentación nacional relacionado a desnutrición, obesidad, alimentos para consumidores de régimen especial, entre otros.