El Laboratorio Costero de Tumbes realiza investigaciones biológico-pesqueras de los principales recursos que sustentan la actividad pesquera en la región, de la calidad acuática y oceanográfica en áreas críticas, de la sanidad acuícola (epidemiología), de los ecosistemas marinos propicios para el desarrollo de la maricultura, y evalúa los niveles poblacionales de invertebrados (concha negra y cangrejo del manglar), para generar o profundizar conocimientos enmarcados en el enfoque ecosistémico para el manejo sustentable de los recursos pesqueros, especialmente de aquellos predominantes o representativos en el ámbito regional, igualmente en lo concerniente a estudios de diagnóstico de la calidad de los ecosistemas acuáticos (marino-costero, canales de marea y ríos) y en la prevención y control de enfermedades en los cultivos de langostinos y en poblaciones silvestres.