El Programa Nacional de Bovinos y Ovinos es el responsable de generar alternativas tecnológicas rentables y amigables con el medio ambiente, a través de la ejecución de proyectos de investigación, con la finalidad de contribuir al desarrollo ganadero, mejorando los índices de producción y de productividad para el mejoramiento de la calidad de vida de la población y al desarrollo sostenible del país. Trabaja en forma articulada con la Dirección General de Ganadería del Ministerio de Agricultura y Riego, y con otras instituciones de investigación a través de alianzas estratégicas a nivel nacional e internacional. Elabora los Planes Operativos de Investigación a través de la demanda tecnológica que son determinados con todos los actores de la cadena de producción de leche, carne y lana de las especies de bovino y ovino